ARES: Apricot genomics and transcriptomics to unravel the genetic bases of resistance to Sharka and the plant/virus interaction

Finanziato dall'Unione Europea - NextGenerationEU a valere sul Piano Nazionale di Ripresa e Resilienza (PNRR) – Missione 4 Istruzione e ricerca – Componente 2 Dalla ricerca all’impresa - Investimento 1.1, Avviso Prin 2022 indetto con DD N. 104 del 2/2/2022, dal titolo "Apricot genomics and transcriptomics to unravel the genetic bases of resistance to Sharka and the plant/virus interaction-ARES", codice proposta 2022F79TR4 - CUP J53D23009980006.

Un importante determinante della resistenza a Sharka (PPVres) è stato identificato sul LG1 di albicocco. Tramite confronto degli aplotipi 'Resistente' e 'Suscettibile' nella regione, sono stati identificati alcuni geni candidati. Il progetto ha i seguenti obiettivi principali:

1. sviluppo di una densa mappa di linkage e analisi QTL su un'ampia progenie disponibile;
2. identificazione di geni candidati e marcatori associati in un insieme di piante resistenti;
3. analisi trascrittomica della cv. ‘Lito’ e degli small RNA per studiare l'espressione genica differenziale e l'effetto di silenziamento durante l'infezione;
4. validazione di geni candidati tramite trasformazione genica, modifica del genoma e silenziamento genico indotto da virus.

Risultati attesi

Il progetto consentirà di ottenere una caratterizzazione più precisa della regione genomica associata alla resistenza a Sharka (PPVres) sul LG1 dell’albicocco, attraverso la costruzione di una mappa di linkage ad alta densità e l’identificazione di QTL rilevanti. Ci si attende inoltre di individuare e validare geni candidati responsabili della resistenza, insieme a marcatori molecolari strettamente associati, utili per programmi di miglioramento genetico assistito.

L’analisi trascrittomica della cv. ‘Lito’ e degli small RNA permetterà di chiarire i meccanismi molecolari alla base della risposta all’infezione, inclusi i processi di regolazione genica e di silenziamento. Infine, la validazione funzionale dei geni candidati, tramite trasformazione genetica, genome editing e silenziamento genico indotto da virus, contribuirà a confermare il loro ruolo nella resistenza, fornendo strumenti innovativi per lo sviluppo di nuove varietà di albicocco resistenti al virus della Sharka.

Dettagli del progetto

• Programma di finanziamento: PRIN 2022
• D.D. del MUR : 104 del 02/02/2022
• Codice progetto MUR:2022F79TR4_001
• CUP:J53D23009980006
• Contributo complessivo UE: € 206.194,00
• Contributo al DISTAL: € 74.330,00
• Durata: 12/10/2023 - 28/02/2026
• Coordinatore: DISTAL
• Responsabile Scientifico: Stefano Tartarini